O primeiro trabalho educacional no Brasil teve início em agosto de 1955, liderado pelo missionário Wayne McAfee, na cidade de Pires do Rio, no estado de Goiás. Inicialmente chamado de “Escola Bíblica de Curto Prazo”, o programa oferecia estudos bíblicos especiais em poucos dias.
A Igreja de Deus recebeu uma doação de terreno no Parque Amazônia em 1956, e em 9 de novembro de 1958, lançou a pedra fundamental para a construção do Instituto Bíblico. Em 5 de janeiro de 1964, o Instituto Bíblico da Igreja de Deus (IBID) foi inaugurado, começando com 12 alunos internos e oferecendo um curso bíblico teológico prático. Em 1976, o nome foi alterado para Seminário Evangélico da Igreja de Deus (SEID), marcando o início dos alunos externos e do curso bíblico por correspondência.
Na Assembleia de 1977, foi criado o Departamento Nacional de Educação (DNE). Atualmente, a instituição inclui seminários regionais, um centro de treinamento missionário e várias extensões pelo Brasil.